次世代シーケンサーメーカー「イルミナ」とは
※このサイトはイルミナをスポンサーとして、Zenken株式会社が運営しています。
次世代シーケンサーを扱う代表的なメーカー「イルミナ」。ここでは代表的な機器や導入事例を踏まえ、特徴を詳しくご紹介します。
次世代シーケンサー
「イルミナ」とは
世界1万以上の研究機関への導入実績が
ある企業
イルミナの次世代シーケンサーの中でも、初導入に特に適した「MiSeq i100 シリーズ」は、これまでに世界1万以上の研究機関・医療機関・企業で採用されてきた実績を持つMiSeq™システムをベースに開発されています。MiSeq™システムは16万件を超える査読付き論文で引用されており、まさに“世界標準”と呼べる装置です※。
こうした実績から、既存研究との比較や再現性が求められる研究領域において、国際的な研究基盤として位置づけられています。
イルミナのサポート体制
国内在籍のサービス＆サポート部が
トラブル時も手厚くサポート
イルミナの本社は米国にありますが、日本国内には日本人のテクニカル／フィールドサポート担当が多数配置されており、導入前後を通じて非常に手厚いサポートを受けられます。多くの担当者が研究職の経験を持つため、単なる操作トラブルの対応にとどまらず、研究目的やサンプル特性に応じた適切な解析手法の提案まで含めたコンサルティングが可能です。
さらに日本国内には専用ラボも整備されており、購入前に実機の見学や試用ができるため、安心して装置の選定を進められます。
イルミナの代表的な
次世代シーケンサー
MiSeq i100 シリーズ
最長の
リード長を実現しラボの可能性を広げる
MiSeq i100 シリーズはイルミナ社が提供するコンパクト、かつ高性能な次世代シーケンサー。最大30Gbの出力と最大2×500bpのリード長を実現し、短時間（約4～24時間）で解析が可能なため、ターゲットシーケンスや小規模ゲノム解析に向いています。
また、操作性と柔軟性に優れていることから、初めて次世代シーケンサーを導入する研究室や、限られた予算・スペースで高精度な解析を行いたい方には特におすすめだと言えるでしょう。
- 出力範囲
- 1.5～30Gb
- ラン1回あたりの
ペアエンドリード - 10～200M
- 最大リード数
- 2x500bp
- ランタイム
- 約4～24時間
MiSeq i100 シリーズの導入事例
国立感染症研究所 インフルエンザウイルス研究センター
同センターの藤崎先生は、次世代シーケンサーがウイルスのような小規模ゲノムの解析において、十分なデータ量を確保しつつランタイムを大幅に短縮できる点を大きな利点として挙げています。実際、300サイクルの試薬を用いれば「朝にセットして夕方には解析へ進める」など、従来に比べて結果取得までのスピードが格段に向上したと語っています。
また、試薬が常温保存に対応したことによる運用面の改善についても言及。従来の凍結保存とは異なり、解凍などの事前準備が不要になったことで「必要な時にすぐ解析を開始できる」柔軟性が生まれ、この変化がスタッフの心理的負担の軽減や、研究業務全体の効率化に大きく寄与していると評価しています。
NextSeq 1000・
NextSeq 2000システム
高性能な
マルチタスク型次世代シーケンサー
NextSeq 1000および2000はイルミナ社の中～大規模研究向け次世代シーケンサーで、最大540Gbの出力と最大2×300bpのリード長を実現。全エクソーム解析やRNA-Seq、シングルセル解析など多様な用途に対応しており、高速かつ高精度な解析が可能です。
柔軟なライブラリー対応と操作性の高さから、複数プロジェクトを並行する研究室や、スループットと効率を重視する施設に向いているといえるでしょう。
- 出力範囲
- 10～540Gb
- ラン1回あたりの
ペアエンドリード - 1億～18億
- 最大リード数
- 2x300bp
- ランタイム
- 8～44時間
NextSeq 2000の導入事例
bitBiome社
同社は、微生物のシングルセル全ゲノム解析を実現する独自技術「bit-MAP®テクノロジー」を確立し、その解析基盤としてイルミナ社の「NextSeq™2000」を採用しています。
CBOのフジオカさんは、NextSeq™2000の持つ処理速度とデータ生産量のバランスは同社技術との親和性が極めて高く、両者を組み合わせることで高精度かつ大量のデータ取得を高速に実現していると語っています。また、機器スペックに加え、万が一のトラブル時におけるイルミナチームの迅速なアフターサポート体制も、安定的な運用を支える信頼の証として高く評価されています。
イルミナの基本情報
（日本法人）
| 会社名 | イルミナ株式会社 |
|---|---|
| 所在地 | 【東京オフィス】東京都港区芝5-36-7 三田ベルジュビル22F 【大阪オフィス】大阪府大阪市淀川区西中島1-11-16 新大阪CSPビル513 |
| 電話番号 | 03-4578-2800 |
| 公式HP | https://jp.illumina.com/ |
「次世代シーケンサーのすゝめ」
次世代シーケンサーは未来の研究や製品開発の可能性を広げる重要な装置です。しかし、初めて次世代シーケンサーを導入する方にはハードルが高く感じられるケースも少なくありません。
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