次世代シーケンサーと他の遺伝子解析手法の違い

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次世代シーケンサーは医療やバイオテクノロジー分野をはじめ、様々な業界でなくてはならない存在になりつつあります。しかし、一方で他の解析方法とどう違うのか、今一つピンと来ない方もいるでしょう。

そこでここでは、主だった解析方法と次世代シーケンサーを比較した上で、その違いについて詳しくご紹介します。

次世代シーケンサーを
利用するメリット

次世代シーケンサーの主なメリットは、膨大な遺伝情報を短時間、かつ高精度で解析できるところにあります。従来の方法に比べてデータ量を多く必要とする場合のコスト効率も高く、全ゲノム解析やRNA-Seq、メタゲノム解析など多様な用途に対応可能です。

また、マルチプレックスにより複数サンプルを同時に解析できるため、研究速度やスループットを大幅に向上させる効果も期待できるでしょう。

今後の研究の可能性を広げる解析方法として、疾患予測や環境モニタリングなど、医療に限らず農業・産業分野での応用も広がっています。

次世代シーケンサーと
他の手法との違い

次世代シーケンサーとサンガー法の違い

サンガー法は1970年代に誕生した解析方法で、DNAの塩基配列を1塩基ずつ丁寧に読み取るのが特徴です。そのため誤差が少なく高精度な結果が期待できますが、次世代シーケンサーに比べると1回の解析量や時間的、手間的なコスト面で劣ると言われています。

では、具体的にどのような違いがあるのでしょうか？ここでは双方を比較し、メリットとデメリットを詳しくまとめました。

次世代シーケンサーと
マイクロアレイの違い

次世代シーケンサーは、未知の配列も含めて網羅的に遺伝情報を解析できるのが特徴です。一方、マイクロアレイは既知の配列に基づいて遺伝子発現や変異を検出するため、解析対象が限定されます。しかし、その分低コストで定量性に優れるため、特定の遺伝子群の比較解析には適している面も。

では、それぞれの解析方法はどのように使い分けられるのでしょうか？ここではメリットとデメリットを比較し、違いを確認してみました。

次世代シーケンサーとqPCRの違い

次世代シーケンサーは、未知の配列なども網羅的に遺伝情報を解析できることから、全ゲノムやトランスクリプトーム解析に適しています。

一方、qPCRは特定の遺伝子の発現量やコピー数を高感度・高精度に定量する手法であり、既知の配列に対する迅速な検出に優れているのが特徴です。ここでは双方の違いを更に詳しく深掘りし、メリットとデメリットをまとめました。