次世代シーケンサーのシェア

※このサイトはイルミナをスポンサーとして、Zenken株式会社が運営しています。

2006年頃に登場してから、次世代シーケンサーは急速な発展を遂げてきました。そこでここでは、その市場の成長要因や将来性なども踏まえ、主要企業の情報などを詳しくご紹介しましょう。

次世代シーケンサー市場の
成長要因

次世代シーケンサーは、遺伝情報を迅速かつ正確に解析するための重要なツールとして世界的に発展してきました。活用される分野としては主に医療・バイオテクノロジー分野が挙げられます。近年では疾患の早期診断・治療選択を求める声も多いため、次世代シーケンサーによる遺伝子検査の需要も高まっているようです。

次世代シーケンサー市場の
今後の予測

次世代シーケンサー市場は臨床・研究用途の拡大により急成長し続けています。近年では個別化医療（プレシジョンメディシン）の普及や高精度、かつ高速な解析が低コストで可能となったことから、今後もより一層導入が進むと予想されているようです。

また、ゲノム医療や研究に対する資金提供・規制緩和など、国家単位でプロジェクトを進めている国が多いため、将来的には更なる技術の発展も期待できるでしょう。

次世代シーケンサーで
高いシェアを占める主要企業

次世代シーケンサーで高いシェアを占める代表的な企業としては、以下が挙げられます。

• イルミナ：多機種を展開し、業界でも大きな存在感を示す
• サーモフィッシャー・サイエンティフィック：臨床・研究両方に強い
• パシフィック・バイオサイエンシズ：高精度ロングリード技術（HiFi reads）で注目される
• オックスフォード・ナノポア・テクノロジーズ：携帯型装置（MinION）など柔軟性が高く、リアルタイム解析が可能

この他にもグローバルに展開する企業が多く、次世代シーケンサーの将来性が窺えます。

次世代シーケンサー市場の
主要企業であるイルミナとは

世界1万以上の研究機関への
導入実績あり

イルミナの次世代シーケンサーの中でも、初導入に特に適した「MiSeq i100 シリーズ」は、これまでに世界1万以上の研究機関・医療機関・企業で採用されてきた実績（2025年12月調査時点）を持つMiSeq™システムをベースに開発されています。MiSeq™システムはさらに、16万件を超える査読付き論文で引用されており、まさに“世界標準”と呼べる装置です（※）。

この豊富な導入実績により、イルミナ装置を使うことで既存の膨大な論文データと自分の研究を比較・再現しやすくなり、論文の説得力も高めやすいという大きなメリットが得られます。

国内在籍の手厚いサポートで
操作トラブルもすぐに解決できる

米国を本拠地とする会社ですが、日本国内に日本人のテクニカルサポートやフィールドアプリケーションサイエンティストが多数在籍し、手厚いサポートを実施しています。

ほとんどが研究者としてのバックグラウンドがあるため、単に操作トラブルの解決だけでなく、目的やサンプルの性質にあわせた解析方法をコンサルティング。日本にはラボも用意されているので購入前にお試しをしたり、実機を見ることが可能です。

イルミナでおすすめの
次世代シーケンサー

MiSeq i100 シリーズ

イルミナ社最速のランタイム、
最長の
リード長を実現しラボの可能性を広げる

イルミナ社のMiSeq i100 シリーズは、中小規模の研究向けに設計された次世代シーケンサーです。省スペースながら高い解析性能を備えており、ターゲットシーケンスや小規模ゲノム解析に活用できます。

研究室単位での導入にも適しており、柔軟で効率的な運用が期待できるでしょう。

出力範囲

1.5～30Gb

ラン1回あたりの
ペアエンドリード

10～200M

最大リード数

2x500bp

ランタイム

約4～24時間

イルミナの公式HPで
製品の詳細を見る

NextSeq 1000・
NextSeq 2000システム

研究スピードを次の次元へ導く
高性能な
マルチタスク型次世代シーケンサー

イルミナ社が高性能ベンチトップ型次世代シーケンサーとして提供するNextSeq 1000、およびNextSeq 2000システム。柔軟性やスループット、解析効率に優れた設計で、特に中～大規模な研究用途に適しています。

また、全エクソーム解析、RNA-Seq、シングルセル解析、16S解析、miRNA解析など、多様な用途に対応しているのも特徴です。

出力範囲

10～540Gb

ラン1回あたりの
ペアエンドリード

1億～18億

最大リード数

2x300bp

ランタイム

8～44時間

イルミナの公式HPで
製品の詳細を見る